@HD VN:1.3 SO:coordinate @SQ SN:chr1 LN:249250621 @SQ SN:chr2 LN:243199373 @SQ SN:chr3 LN:198022430 @SQ SN:chr4 LN:191154276 @SQ SN:chr5 LN:180915260 @SQ SN:chr6 LN:171115067 @SQ SN:chr7 LN:159138663 @SQ SN:chrX LN:155270560 @SQ SN:chr8 LN:146364022 @SQ SN:chr9 LN:141213431 @SQ SN:chr10 LN:135534747 @SQ SN:chr11 LN:135006516 @SQ SN:chr12 LN:133851895 @SQ SN:chr13 LN:115169878 @SQ SN:chr14 LN:107349540 @SQ SN:chr15 LN:102531392 @SQ SN:chr16 LN:90354753 @SQ SN:chr17 LN:81195210 @SQ SN:chr18 LN:78077248 @SQ SN:chr20 LN:63025520 @SQ SN:chrY LN:59373566 @SQ SN:chr19 LN:59128983 @SQ SN:chr22 LN:51304566 @SQ SN:chr21 LN:48129895 @SQ SN:chr6_ssto_hap7 LN:4928567 @SQ SN:chr6_mcf_hap5 LN:4833398 @SQ SN:chr6_cox_hap2 LN:4795371 @SQ SN:chr6_mann_hap4 LN:4683263 @SQ SN:chr6_apd_hap1 LN:4622290 @SQ SN:chr6_qbl_hap6 LN:4611984 @SQ SN:chr6_dbb_hap3 LN:4610396 @SQ SN:chr17_ctg5_hap1 LN:1680828 @SQ SN:chr4_ctg9_hap1 LN:590426 @SQ SN:chr1_gl000192_random LN:547496 @SQ SN:chrUn_gl000225 LN:211173 @SQ SN:chr4_gl000194_random LN:191469 @SQ SN:chr4_gl000193_random LN:189789 @SQ SN:chr9_gl000200_random LN:187035 @SQ SN:chrUn_gl000222 LN:186861 @SQ SN:chrUn_gl000212 LN:186858 @SQ SN:chr7_gl000195_random LN:182896 @SQ SN:chrUn_gl000223 LN:180455 @SQ SN:chrUn_gl000224 LN:179693 @SQ SN:chrUn_gl000219 LN:179198 @SQ SN:chr17_gl000205_random LN:174588 @SQ SN:chrUn_gl000215 LN:172545 @SQ SN:chrUn_gl000216 LN:172294 @SQ SN:chrUn_gl000217 LN:172149 @SQ SN:chr9_gl000199_random LN:169874 @SQ SN:chrUn_gl000211 LN:166566 @SQ SN:chrUn_gl000213 LN:164239 @SQ SN:chrUn_gl000220 LN:161802 @SQ SN:chrUn_gl000218 LN:161147 @SQ SN:chr19_gl000209_random LN:159169 @SQ SN:chrUn_gl000221 LN:155397 @SQ SN:chrUn_gl000214 LN:137718 @SQ SN:chrUn_gl000228 LN:129120 @SQ SN:chrUn_gl000227 LN:128374 @SQ SN:chr1_gl000191_random LN:106433 @SQ SN:chr19_gl000208_random LN:92689 @SQ SN:chr9_gl000198_random LN:90085 @SQ SN:chr17_gl000204_random LN:81310 @SQ SN:chrUn_gl000233 LN:45941 @SQ SN:chrUn_gl000237 LN:45867 @SQ SN:chrUn_gl000230 LN:43691 @SQ SN:chrUn_gl000242 LN:43523 @SQ SN:chrUn_gl000243 LN:43341 @SQ SN:chrUn_gl000241 LN:42152 @SQ SN:chrUn_gl000236 LN:41934 @SQ SN:chrUn_gl000240 LN:41933 @SQ SN:chr17_gl000206_random LN:41001 @SQ SN:chrUn_gl000232 LN:40652 @SQ SN:chrUn_gl000234 LN:40531 @SQ SN:chr11_gl000202_random LN:40103 @SQ SN:chrUn_gl000238 LN:39939 @SQ SN:chrUn_gl000244 LN:39929 @SQ SN:chrUn_gl000248 LN:39786 @SQ SN:chr8_gl000196_random LN:38914 @SQ SN:chrUn_gl000249 LN:38502 @SQ SN:chrUn_gl000246 LN:38154 @SQ SN:chr17_gl000203_random LN:37498 @SQ SN:chr8_gl000197_random LN:37175 @SQ SN:chrUn_gl000245 LN:36651 @SQ SN:chrUn_gl000247 LN:36422 @SQ SN:chr9_gl000201_random LN:36148 @SQ SN:chrUn_gl000235 LN:34474 @SQ SN:chrUn_gl000239 LN:33824 @SQ SN:chr21_gl000210_random LN:27682 @SQ SN:chrUn_gl000231 LN:27386 @SQ SN:chrUn_gl000229 LN:19913 @SQ SN:chrM LN:16571 @SQ SN:chrUn_gl000226 LN:15008 @SQ SN:chr18_gl000207_random LN:4262 @PG ID:bwa PN:bwa VN:0.7.10-r789 CL:bwa samse hg19.fa OCB_S6_S37_trimmed.sai OCB_S6_S37_trimmed.fastq