Bueno la solución llego cuando lei lo que arrojaba la shell,
edite el archivo
~/rizoma/src/postgresql-function.h
Y en la linea 23 cambie
#include <libpq-fe.h>
por
#include <postgresql/libpq-fe.h>
lo mismo para el archivo
~/rizoma/src/rizoma-config.c
La linea 24
#include <libpq-fe.h>
#include <postgresql/libpq-fe.h>
Y listo pudimos compilar rizoma con GDB, de la siguiente forma
$./autogen.sh
$make CFLAGS='-ggdb -O0'
#make install
Y listo.
PD: Este error sucede en las distribuciones basadas en debian.
PD2: Si se compila solo con make, no hay necesidad de cambios ya que no arroja ningun error es solo al intentar compilarlo con las flags GDB
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